Центральная акцизная таможня (ЦАТ) входит в состав единой федеральной централизованной системы таможенных органов Российской Федерации. Сфера ее компетенция ограничивается отдельными правомочиями для совершения таможенных операций в отношении подакцизных и других определенных видов товаров, перечень которых определяется ФТС России в приказе №1286 от 8 декабря 2006 г. «Об утверждении Положения о Центральной акцизной таможне».

В структуре ЦАТ функционирует 17 таможенных постов, которые расположены в четырёх федеральных округах, из которых 12 располагаются в Центральном федеральном округе, 2 в Северо-Западном федеральном округе, 2 в Южном федеральном округе и 1 на территории свободного порта Владивосток. С 14 февраля 2019 года в ее структуре начал функционировать Акцизный специализированный таможенный пост или по другому, центр электронного декларирования. Компетенция ЦЭД ограничивается исключительно совершением таможенных операций в электронной форме. Первоначально декларирования товаров на ЦЭД планируется начать путем перераспределения декларационного массива Крекшинского акцизного таможенного поста.

С другими таможенными постами ЦАТ будет взаимодействовать согласно планам-графикам, разработанными с учетом готовности и возможности таможенных органов, участников ВЭД. В связи с этим проводится увеличение штатной численности на таможенных постов и в ЦАТ, в период с 15 февраля по 07 марта 2019 будет проводиться первого этапа конкурса на замещение вакантных должностей государственной гражданской службы Российской Федерации в АСТП ЦЭД.